Die Mitgliederversammlung des Instituts für Europäische Politik hat Axel Schäfer zum Vize-Präsidenten gewählt. Das IEP als gemeinnützige Organisation zählt zu den führenden außen- und europapolitischen Forschungseinrichtungen der Bundesrepublik Deutschland. Seine Aufgabe ist es, Themen europäischer Politik und Integration wissenschaftlich zu untersuchen und die praktische Anwendung der Ergebnisse zu fördern.

Axel Schäfer ist neben seiner Tätigkeit als Abgeordneter ehrenamtlich als Lehrbeauftragter an der Technischen Fachhochschule Georg Agricola zu Bochum und an der Fernuniversität Hagen im Kuratorium des Dimitris-Tsatsos-Institut für Europäische Verfassungswissenschaften tätig.